配列相同性検索プログラムGHOST-MPの講習会とSCLS計算機システム(京互換機)を用いた実習を開催します。
GHOST-MPは、高速な配列相同性検索を行うGHOSTXアルゴリズムを、分散メモリシステム向けに並列化したソフトウェアです。次世代シークエンサー等で得られた大量の短い塩基配列またはアミノ酸配列を入力し、アミノ酸配列データベースに対する相同性検索を短時間で実行でき、メタゲノム解析などの用途に適します。講習会では、GHOST-MPのしくみと利用方法を説明し、GHOST-MPを用いたメタゲノムデータ解析の実習を行いました。