事業実績

2015年09月01日(火)

「REIN-K」レプリカ交換分子動力学計算インターフェイス・ソフト および 「CafeMol」粗視化分子モデル計算ソフト講習会

以下のアプリケーションの講習会を開催しました。

●　REIN-K: レプリカ交換分子動力学計算インターフェイス・ソフトウェア
タンパク質のまわりの環境を含めたタンパク質の構造予測や、構造変化予測、自由エネルギー計算等を効率良く行なうためののプログラム。多次元レプリカ交換分子動力学計算を行なう。「京」用にhybrid並列コンパイルしたNAMDを分子動力学計算に用いるが、その他のプログラムにも対応予定。

●「CafeMol」粗視化分子モデル計算ソフト
粗視化された分子モデルによる古典分子動力学法により大規模生体分子の長時間シミュレーションを行うソフトウェア。解析例として、キネシンの動態、多剤排出トランスポーターの動態、DNAヒストン複合系(ヌクレオソーム)などがある。

【主　　催】理化学研究所 情報基盤センター
【共　　催】(公財)都市活力研究所、理化学研究所　HPCI戦略プログラム 戦略分野1
【協　　賛】バイオグリッドセンター関西、バイオスーパーコンピューティング研究会、産業技術総合研究所 ゲノム情報研究センター(CBRC)
日時 2015年09月01日(火)
13:30-17:00
開催場所 東京会場: 国立研究開発法人　理化学研究所　東京連絡事務所　西会議室
　　(東京都千代田区内幸町2-2-2 富国生命ビル23階 2311号室)
　　　TEL: 03-3580-1981
大阪会場: 公益財団法人都市活力研究所 (NPO法人バイオグリッドセンター関西) 会議室
　　 (大阪市北区大深町3-1グランフロント大阪　タワーC 7F)
　　　TEL:06-6359-1322
プログラム 開始: 13:30 (受付開始 12:45)
1. REIN-K 講習および質疑応答 (13:30-15:00)
　　休憩 (15:00-15:15)
2. CafeMol講習および質疑応答 (15:15-16:45)
終了:17:00
講師
REIN-K 講師: 宮下尚之 (REIN-K開発者、近畿大学 生物理工学部 准教授、理研 客員研究員)
CafeMol 講師: 検崎博生 (CafeMol開発者、理研 情報基盤センター 技師・研究員)
参加費 無料
参加人数 22名

≫事業実績一覧へ戻る